本体项目汇总

下面陆续整理国内外的本体示例、项目及其链接。

1. 生物领域的本体

Bio-Ontologies: A List of links

1.1 基础本体

1.1.1 The Open Biological and Biomedical Ontologies(OBO)
中文名称:开放性生物与生物医学本体
参考链接:http://www.obofoundry.org/

1.2 生物本体

1.2.1 Gene Ontology(GO)
中文名称:基因本体
参考链接:
(1)http://www.geneontology.org/
(2)http://202.38.126.151/index.php/基因本体GO
1.2.2 Protein Ontology(PRO)
中文名称:蛋白质本体
参考链接:
(1)http://pir.georgetown.edu/pro/pro.shtml
(2)http://bioportal.bioontology.org/ontologies/1052
(3)http://obofoundry.org/cgi-bin/detail.cgi?id=protein
1.2.3 Amino Acid Ontology(AAO)
中文名称:氨基酸本体
参考链接:http://www.co-ode.org/ontologies/amino-acid/2009/02/16/
1.2.4 Plant Ontology(PO)
中文名称:植物本体
参考链接:http://www.plantontology.org/
1.2.5 Extensible Observation Ontology(OBOE)
中文名称:可扩展性观测本体
参考链接:
(1)https://marinemetadata.org/references/oboeontology
(2)https://semtools.ecoinformatics.org/oboe
(3)http://ecoinformatics.org/ontologies/observation-0.1.5
参考文献:
MADIN J, BOWERS S, SCHILDHAUER M, et al. An ontology for describing and synthesizing ecological observation data[J]. Ecological Informatics, 2007, 2(3): 279-296.
1.2.6 Cell Cycle Ontology(CCO)
中文名称:细胞周期本体
参考链接:http://www.semantic-systems-biology.org/apo/
1.2.7 Foundational Model of Anatomy ontology(FMA)
中文名称:解剖学基础模型本体
参考链接:http://sig.biostr.washington.edu/projects/fm/index.html

1.3 医学本体

1.3.1 The Blood Ontology(BLO)
中文名称:血液本体
参考链接:http://mba.eci.ufmg.br/BLO/index.html

1.4 相关项目

1.4.1 The Science Environment for Ecological Knowledge(SEEK)
中文名称:生态知识科学环境
参考链接:http://seek.ecoinformatics.org/
1.4.2 NCBO Bioportal
参考链接:
(1)http://bioportal.bioontology.org/
(2)http://www.bioontology.org/

One thought on “本体项目汇总

  1. wangtj
    2013-04-24 at 05:05

    你好,我网上看说PROTEGE4.X版的不像3.x版的可以把本体存入数据库,是不是可以利用JENA完成本体数据存入数据库?或者说4.X版的能不能实现存入数据库?我需要中文本体库,试了其它的都不能显示中文关系图,只有你说的4.1的可以,在线请教

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